Jean-Charles Ducène est licencié en Philologie et histoire orientales (ULB, 1994) et docteur en Philosophie et lettres de cette même université (2002). Il a à cette occasion soutenu une thèse ayant pour objet l’édition, la traduction et le commentaire du Kitāb dalā’il al-qibla d’Ibn al-Qâss (IVe/Xe siècle). Depuis septembre 2004, il enseigne à l’ULB l’histoire des peuples arabes et musulmans.

En décembre 2010, il a obtenu son Habilitation à diriger des recherches, l’à EPHE, à Paris. Ses recherches portent notamment sur la géographie et la cartographie arabes médiévales abordées sous deux axes : d’abord comme témoins de l’évolution des idées et de la représentation du monde, mais aussi comme sources d’informations positives en géographie historique. Il s’intéresse aussi à la manière dont les érudits européens ont utilisé les auteurs orientaux de la Renaissance au XVIIIe siècle.